Врачи, которые лечат пациентов, страдающих определёнными формами рака участков головы и шеи, часто говорят, что чувствуют специфический запах, исходящий от своих пациентов. Близкие больных также часто подтверждают это.
Это были наблюдения. Но теперь, благодаря достижениям в области секвенирования генома, у учёных появились данные, дающее объяснение этому. Возможно, изменения в бактериальном сообществе в организме этих пациентов являются причиной такого запаха.
Для этого учёные изучали геном бактерий, живущих в организме человека, пытаясь понять, как они взаимодействуют с генами человека и влияют на развитие болезней.
Микробиомика как новое направление науки появилось после того как выяснилось, что кишечные бактерии H. Pylori могут приводить не только к язвенной болезни желудка, но и к раку желудка.
Для плоскоклеточного рака головы и шеи — на долю которого приходится более 500 тысяч новых случаев заболевания каждый год – факторами риска являются употребление табака и алкоголя.
Тем не менее, даже с уменьшением уровня табакокурения и употребления алкоголя смертность от этих видов рака остаётся довольно высокой. Для ответа учёные обратились к микробиому.
В пилотном исследовании они сравнивали ткани 44 раковых опухолей с образцами здоровых тканей тех же самым пациентов и обнаружили наличие различий в микробиоме. В образцах опухолей увеличилось метилирование в четырёх генах — MDR1, IL8, RARB, TGFBR2 — связанных с этими типами рака.
Проще говоря: бактерии, по-видимому, взаимодействуют с этими генами, побуждая их способствовать росту опухоли, вместо того, чтобы подавлять её. Кроме того, изменения в бактериальном сообществе в тканях опухоли были связаны с поздними стадиями рака.