В последние годы была разработана новая эффективная методика секвенирования вирусов, вызывающих болезни людей и животных.
Мобильные лаборатории используют ее в полевых условиях для проведения практически мгновенной диагностики опасных вирусов, таких как лихорадок Эбола или Зика. Такая диагностика проводится быстро и прямо на месте, что исключает необходимость перемещения зараженных образцов в удалённые лаборатории.
Подпись к изображению: Новая методика позволяет обнаруживать вирусы в полевых условиях, а данном случае это участок с ямсом в Гваделупе
«Эта технология предусматривает получение длинных нуклеотидных последовательностей, что позволяет секвенировать весь вирусный геном», — объясняет Филипп Руманьяк, вирусолог из CIRAD, одной из первых лабораторий в мире, которая проверила и подтвердила эффективность использования сходной методики в вирусологии растений.
«Используя больное растение батата, нам потребовалось всего несколько часов, чтобы упорядочить весь геном двух однонитевых РНК-вирусов, маклюравируса и потивируса», — добавляет его коллега Дени Филлу.
Как и в случае с вирусологией человека, факт, что метод в настоящее время проверен в лаборатории вирусологии растений, открывает путь для способов быстрого обнаружения хронических, сезонных или спорадически возникающих вирусных болезней у растений в режиме реального времени, даже в удаленных изолированных районах.
Поскольку значительно сокращается время, которое проходит между отбором проб и диагностикой, технология секвенирования вирусов болезней растений поможет органам эпидемиологического надзора обнаруживать вредные организмы на более ранней стадии распространения.
Данная работа была проведена международной группой исследователей, включающей учёных из лаборатории CIRAD, а также их европейских, индийских и южноафриканских партнеров.